Ludger Kisters studierte Komposition bei Michael Obst in Weimar und Jack Body in Wellington sowie elektroakustische Komposition bei Robin Minard in Weimar und Germán Toro Pérez in Zürich. Während dieser Zeit besuchte er verschiedene Kompositionskurse, u.a. am IRCAM, Paris. 

Kisters war Stipendiat des Künstlerhof Schreyahn und des DAAD, außerdem Gastkomponist am ICST Zürich und an der TU Berlin. 2008 nahm er an einer Expedition teil, um Klänge im Amazonas-Regenwald für einen Auftrag des Bayerischen Rundfunks aufzunehmen. 2019 initiierte Kisters mit Gisela Nauck und Uli Aumüller das Festival Mühlenbecker Klanglandschaften. Veröffentlichungen seiner Werke finden sich u.a. auf den CDs der DEGEM, bei Arthaus Musik und bei Schott. Das Werkverzeichnis umfasst elektroakustische Musik, Kammermusik, Vokalmusik und Orchesterwerke sowie Klanginstallationen und multimediale Kompositionen, interpretiert u.a. durch das Ensemble Modern, das Arditti quartet, Claudia Buder, Carin Levine, Wu Wei, RIAS Kammerchor Berlin, die Staatskapelle Weimar und das MDR-Sinfonie-Orchester.